Transkripsiyonda neden Timin-Urasil değişikliği yapılıyor?

 Transkripsiyonda timin yerine urasil kullanımı çok önemli olabilir.

Ökaryotlarda DNA hücre çekirdeğindedir ve dış zararlı etkenlerden korunur. Prokaryotlarda hücre sitoplazmasında bulunur. Timin-Urasil değişiminin nedenlerinden biri DNA'nın çekirdekte kalması ve orijinal yapısını koruması olabilir. Ayrıca urasil, başlangıç ​​ve bitiş kodonunun yapısında belirli bir konumda yer alarak protein sentezinde önemli bir rol oynar. Triptofan için özel kodon UGG'dir. İlk harfi U ve iki harfli purin (GG) ile benzersiz ve özel bir kodon yapısına sahiptir. UAA-UAG-UGA durdurma kodonlarıdır ve anti-kodonları yoktur. Durdurma kodonlarında purin ve pirimidin bazlarının lokalizasyonu dikkat çekicidir. Pirimidin olarak sadece urasil vardır ve durdurma kodonlarında her zaman ilk harf olarak bulunur ve diğer iki harf her zaman purindir. Eğer UAA-UAG-UGA durdurma kodonları antikodon olsaydı, AUU-AUC-ACU olmak zorunda kalırlardı. İlk harfi Adenin olan bir anti-kodon yoktur. Durdurma kodonları, alışılmadık moleküler kodon dizisi nedeniyle ribozomlar ve tRNA tarafından tanınmayabilir ve bu nedenle protein sentezi sonlandırılabilir.

Kısa bir mRNA molekülünde sıra halinde dizilmiş kodonlar. Her bir kodon üç nükleotidden oluşur ve tek bir aminoasiti kodlar

Bu tablo 64 kodonu ve her kodonun kodladığı aminoasitleri göstermektedir. Kodonların DNA'daki yönü: 5'→3' şeklindedir.

		2. baz
		U	C	A	G
1. baz	U	UUU (Phe/F)Fenilalanin UUC (Phe/F)Fenilalanin UUA (Leu/L)Lösin UUG (Leu/L)Lösin	UCU (Ser/S)Serin UCC (Ser/S)Serin UCA (Ser/S)Serin UCG (Ser/S)Serin	UAU (Tyr/Y)Tirozin UAC (Tyr/Y)Tirozin UAA Ochre (Stop) UAG Amber (Stop)	UGU (Cys/C)Sistein UGC (Cys/C)Sistein UGA Opal (Stop) UGG (Trp/W)Triptofan
	C	CUU (Leu/L)Lösin CUC (Leu/L)Lösin CUA (Leu/L)Lösin CUG (Leu/L)Lösin	CCU (Pro/P)Prolin CCC (Pro/P)Prolin CCA (Pro/P)Prolin CCG (Pro/P)Prolin	CAU (His/H)Histidin CAC (His/H)Histidin CAA (Gln/Q)Glutamin CAG (Gln/Q)Glutamin	CGU (Arg/R)Arginin CGC (Arg/R)Arginin CGA (Arg/R)Arginin CGG (Arg/R)Arginin
	A	AUU (Ile/I)İzolösin AUC (Ile/I)İzolösin AUA (Ile/I)İzolösin AUG (Met/M)Metiyonin, Start[1]	ACU (Thr/T)Treonin ACC (Thr/T)Treonin ACA (Thr/T)Treonin ACG (Thr/T)Treonin	AAU (Asn/N)Asparagin AAC (Asn/N)Asparagin AAA (Lys/K)Lizin AAG (Lys/K)Lizin	AGU (Ser/S)Serin AGC (Ser/S)Serin AGA (Arg/R)Arginin AGG (Arg/R)Arginin
	G	GUU (Val/V)Valin GUC (Val/V)Valin GUA (Val/V)Valin GUG (Val/V)Valin	GCU (Ala/A)Alanin GCC (Ala/A)Alanin GCA (Ala/A)Alanin GCG (Ala/A)Alanin	GAU (Asp/D)Aspartik asit GAC (Asp/D)Aspartik asidt GAA (Glu/E)Glutamik asit GAG (Glu/E)Glutamik asit	GGU (Gly/G)Glisin GGC (Gly/G)Glisin GGA (Gly/G)Glisin GGG (Gly/G)Glisin

(Tablolar Wikipedia'dan alınmıştır)

mRNA kodonlarındaki Adenin ve Urasil pozisyonları, moleküler tanıma mekanizmasında özel bir öneme sahip olabilir. 5-floro urasil (5FU) kanser tedavisinde kullanılır. Urasil ve 5-Fu pirimidin analoğudur. Bu gerçek, urasil'in kanser tedavisindeki bir diğer önemini de gösterebilir.